O defesa-central visitante, David Brekalo, ficou sem marcação ao cabecear na sequência de um livre de Eduard Atuesta, a apenas sete minutos do fim.
O extremo Ivan Angulo aumentou a vantagem do City aos 29 minutos com um poderoso remate rasteiro para o canto mais distante, à entrada da grande área.
A lenda francesa Antoine Griezmann marcou sua estreia após a transferência do atacante de 35 anos do Atlético de Madrid ao chutar de dentro da área, três minutos após o intervalo, quando Gunn ficou exposto devido à perda de posse de bola.
O meio-campista paraguaio Braian Ojeda completou a goleada aos 73 minutos, com sua cabeçada entre Gunn e o poste próximo em outra bola parada de Atuesta.
Na outra ponta, o adversário de Gunn, o canadense Maxime Crepeau, fez várias boas defesas, algumas negando a Timo Werner uma estreia como goleiro pelo San Jose após a transferência do atacante alemão do RB Leipzig.
Apesar da derrota, a equipe de Gunn continua empatada em pontos na liderança da Conferência Oeste, mas em segundo no saldo de gols, atrás do Vancouver Whitecaps, que perdeu por 4 a 3 fora para o Cincinnati, mas tem um jogo a menos.
San Jose está em quarto lugar na tabela geral, com Nashville liderando, à frente do Inter Miami, do atacante argentino Lionel Messi.
A próxima equipe de Gunn receberá o LA Galaxy, que está em nono lugar na Conferência Leste, no domingo.